反渗透膜元件作为深层的过滤手段，其表面不可避免的会残留有胶体、微生物、杂质颗粒及难溶盐类在其表面的析出，因此，在多种领域使用的反渗透装置，一旦投入使用，最终都需要清洗，只是清洗周期的长短不同而已。通常情况下，根据污染情况的不同，反渗透清洗采用不同的清洗方式，其中包括在线清洗和离线清洗两种。

在线清洗：

清洗条件

1)系统的段间压差：一段压差≤0.2Mpa；二段压差≤0.1Mpa。

2)在系统运行参数不变的情况下，通过温度校正系统的产水量恢复设计产水量的85%以上。

3)产水脱盐率变化不超过5%

离线清洗；

（1）反渗透膜元件污染符合“重度污染”标准；

（2）反渗透系统通过在线清洗不能够达到系统额定标准的；

（3）水处理系统由于供水紧张而不能够进行在线清洗或没有在线清洗设备的；

（4）反渗透污染类型较为复杂，通过在线清洗容易引起交叉污染的；